【ご質問】
パッケージキャッシュを利用している場合、サーバ側で削除したパッケージはクライアント側のキャッシュからは削除されないのでしょうか？
 
【回答】   
サーバ側でパッケージファイルを削除しても、キャッシュ領域が一杯になる、またはキャッシュの期限が切れない限り、クライアント側のキャッシュは自動削除されません。こちらはCurlの仕様となっております。
詳しくは次のCurl IDEドキュメントを参照してください：
Curl IDEドキュメント→目次→CURL→Curl 開発者ガイド→コンテンツの構成要素→キャッシュと同期