◆ご質問◆
 通常のWebアプリケーションにおいては、通信プロトコルの指定やsecure属性の付与は
 APサーバ側の設定で行い、アプリ側ではあまり意識するのもではないかと思いますが、
 CurlではCookieの取得・設定・クリアにおいて通信がセキュアであるか否かによって
 メソッドを使い分けるようになっているかと思います。

 通常のWebアプリケーションと同様に、アプリケーション(アプレット)側で通信プロトコルを
 意識しない実装を行う方法はありますでしょうか。

◆回答◆
標準のAPIでは、アプレット側で通信プロトコルを意識しない実装方法はありません。

しかし、アプレット側で意識しないような実装を行うには、
HttpCookieオブジェクト生成する処理をラップしたプロシージャ等を作成し、
その中で通信プロトコルに応じて動的にsecure?を変更することで可能となります